国际研究团队开发出区别相似微生物的新基因组测序技术

2022-01-08  美国 来源:其他 作者:张芮晴 领域:生物

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据转化医学网1月5日消息,美国农业部、加州大学圣地亚哥分校、生物技术公司Pacific Biosciences以及俄罗斯、以色列和荷兰的国际研究团队表明,高精度、长读长的基因组测序技术“HiFi”结合先进算法,可区分几乎相同的生物,使研究人员能更完整全面地分类微生物群落。长读长技术可分析更大的DNA片段(超15000个碱基对),可对微生物组中几乎所有的细菌进行全基因组测序,更易区分仅有微小基因组变异的微生物。研究团队利用HiFi长读长和相关算法对羊肠道中的微生物宏基因组进行测序,从428个物种中鉴定出基因组,完整性超90%,为充分描绘样本的微生物补体提供新工具。微生物栖息在人类、动植物身体和整个环境中,并能帮助诊断癌症、破译赤潮、研究海洋中的塑料生物降解以及测量碳释放和捕获等,因此该技术具有巨大应用潜力,可为许多科学工作提供信息。相关研究成果发表于《Nature Biotechnology》期刊。

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