据科学网12月8日消息，西湖大学、厦门大学、德睿智药的研究人员开发出能够预测蛋白质构象变化与亲和力预测的AI模型ProtMD，可精准筛选高活性小分子，加速临床前药物研发。该团队选取十个代表性的蛋白质结构进行分子动力学模拟，根据其空间运动轨迹，建立蛋白质动态构象模型。该模型可基于给定药物分子和生物体内靶点蛋白，预测二者结合后蛋白质结构的变化过程，推断药物与靶标蛋白结合的亲和力、稳定性，从而评估药物功能，其轻量级版本模型在该任务中表现已超过现有最优模型。该研究突破了AlphaFold2只能预测蛋白质瞬间静态结构的限制，为提高AI药物筛选准确性和效能提供了重要思路，对理解生命过程、研发新型药物具有重要意义。相关研究成果发表于Advanced Science期刊。

消息来源：https://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/490848.shtm