美国NIH开发软件可按需组装完整的基因组序列

2023-02-18  美国 来源:其他 作者:戴吉 领域:生物

关键词:

据NIH官网2月16日消息,美国国立卫生研究院发布创新软件工具Verkko,用于自动化组装来自各物种的完整、无间隙基因组序列。该软件基于2022年3月T2T联盟完成的首个无间隙人类基因组序列进行优化,利用小而详细的DNA片段创建出部分组装但断开的序列,再利用大但不精确的部分用作框架对详细区域进行排序,最终形成准确而完整的基因组序列,实现一键获取各物种完整、无间隙基因组序列。经测试,该软件可快速准确地组装人类和非人类整个染色体的序列。该软件为研究人员提供更多无间隙基因组序列进行人类基因组多样性的评估。

消息来源:https://www.nih.gov/news-events/news-releases/nih-software-assembles-complete-genome-sequences-demand