瑞士科研团队开发出高效精准预测蛋白质结合界面的深度学习模型

2023-04-28  瑞士 来源:其他 作者:戴吉 领域:生物

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据ScienceAI公众号4月25日消息,瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)和瑞士生物信息学研究所开发出一种蛋白质结合界面的通用预测器PeSTo,提供准确、灵活、快速且用户友好的解决方案。该团队提出一个基于旋转等变transformer的神经网络模型,可直接作用于仅标有元素名称的原子坐标,同时以此构建蛋白质结合界面的通用预测器PeSTo可以高置信度预测和区分涉及核酸、脂质、离子和小分子的界面,且无需系统物理参数化,实现低计算成本处理大量结构数据集。该研究可用于剖析蛋白质广泛而动态的相互作用景观,以及发现新的生物学见解。相关研究成果发表于Nature Communications期刊。

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